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上海市胸科医院，是我国最早建立的集医疗、教学、科研为一体的，以诊治心、肺、食管、气管、纵隔疾病为主的三级甲等专科医院。2004年成为上海红十字胸科医院，2005年成为上海交通大学附属胸科医院。

1957年11月2日，上海市人民政府集结全市心胸疾病领域的力量组建上海市胸科医院。我国心胸外科四大奠基人中的三位：黄家驷教授、兰锡纯教授、顾恺时教授，分别担任胸科医院首任院长、副院长。

医院现建有心外科、心内科、胸外科、呼吸内科、肿瘤科、中西医结合科、急诊科、重症监护科、放疗科、麻醉科等10个临床科室，以及放射科、病理科、药剂科、检验科、核医学科、超声诊断科、心功能室、肺功能室、呼吸内镜室、营养室等10个医技科室。拥有国家重点学科（心血管病学），国家临床重点专科（胸外科专业、心血管内科专业、心脏大血管外科专业），国家中医药管理局“十二五”重点专科（中西医结合肿瘤科），上海市临床重点专科（胸外科、呼吸内科），上海市肺部肿瘤临床医学中心（肿瘤科），上海市医学重点学科等重点学科。医院是全国首家国际认证胸痛中心，首批中国胸痛中心、首批中国心衰中心、首批中国房颤中心，拥有上海市首批癌痛示范病房，并有上海交通大学房颤诊治中心和上海交通大学食管疾病诊治中心。